Kustbevakningen bedriver tillsyn utifrån jaktförordningen. Kontrollverksamheten inom jakt omfattar främst sjöfågel- och säljakt. Kustbevakningen har befogenhet att kontrollera jaktkort och vapenlicens om jakten bedrivs från båt. När det gäller jägare som befinner sig på land i anslutning till Kustbevakningens geografiska verksamhetsområde, är myndighetens befogenheter begränsade till att endast kontrollera att jägaren har jaktkort.

Jakt från båt har ökat under senare år, genom att fler beslut om skyddsjakt på skarv och säl har utfärdats av länsstyrelser längs Sveriges kuster.